El 24 de mayo de año 1927 es fundado nuestro Club. Ese día se forma el Club Deportivo Universitario y que es una unión entre el Club Náutico Universitario, Internado fútbol Club (perteneciente al Instituto Nacional Barros Arana), el Universitario de Atletismo y la Federación Universitaria. La insignia será un chuncho, emblema que formaba parte del escudo del Club Náutico.
Pero un antecedente anterior a la formación del Club Deportivo Universitario, lo entrega la revista “U”, fundada en el año 1945 por el periodista Julio Moreno T. Según esta publicación, es a partir de la primera década del siglo XX se encuentran los primeros inicios fundacionales del club. Y es a través de las competencias deportivas entre universidades, como por ejemplo en el año 1908 con el clásico universitario, en el año 1911 con la creación del Internado Fútbol Club y que a su vez, fue creado por alumnos universitarios y ex alumnos del Instituto Nacional Barros Arana.
Otro de los antecedentes en la fundación de nuestro Club Universitario de Deportes, se da el año 1923 con la creación de la Federación Deportiva de la Universidad de Chile, formada por las distintas facultades y escuelas de la época, siendo su primer presidente el Sr. Arturo Flores Conejeros. En la misma década del 20`, más precisamente en 1926, otro de los precedentes es el Club Náutico Universitario” que se crea ese año, luego vendrá la construcción de la Piscina Escolar (1929).
Son estas tres entidades deportivas que dan paso a la fundación del Club Universitario. Institución que se incorpora en el año 1928, en la "Liga Central de Fútbol de Santiago", debutando contra el "Unión Condell". Oportunidad en la que presentan una novedad, que a la larga sería muy significativa: cada uno de los jugadores lleva en su casaquilla el emblema de un chuncho.
Ya en 1930 se forma el club Universitario de Deportes en la cual participan tres entidades deportivas y que son; El Club Universitario, La Federación Deportiva de la Universidad de Chile y La Federación Deportiva de la Universidad Católica. Formación que durará hasta el año 1935.
En el año 1939 el deportivo Universitario participa en la liga amateur de la “Liga Central de Fútbol”. Y el 1936 gana su primer torneo de la división B, triunfo que repetirá un año más tarde. Luego de dos torneos ganados en la seria B, el Club Deportivo Universitario solicitará su ascenso a la primera división, año que también marcará el cambio de nombre de la institución. Pasa a llamarse Club Deportivo Universidad de Chile ya que los estudiantes de la Universidad Católica se retiran para formar su propio Club de fútbol, inexistente en esa casa de estudio hasta esa fecha.
Como ambas instituciones solicitaron el ascenso a la primera división, habiendo cupo sólo para uno. La liga Central de Fútbol decidió que la forma de elegir a uno de ellos era a través de dos partidos. Al Club deportivo de la Universidad Católica le tocó enfrentar a Colo Colo , perdiendo por 6 goles a 2. Por su parte, el Club Deportivo de la Universidad de Chile debió enfrentar a Audax Italiano. Encuentro que terminó empatado a un gol, paridad que no varió en los dos tiempos suplementarios. El partido entonces, se debió definir por muerte súbita y en donde el club itálico anotó el gol de oro, ganando por dos a uno el partido.
A pesar de la derrota, la buena actuación del equipo, dejó conformes a los dirigentes y es por ello que aceptan al Club Deportivo Universidad de Chile en el fútbol Profesional. Su debut profesional será el 29 de mayo de 1938, oportunidad en la enfrentó e Magallanes en los Campos Sports de la comuna de Ñuñoa.
1965 El primer Bicampeonato
Carlos Contreras, Roberto Hodge, Hugo Villanueva, Humberto Donoso, Luis Eyzaguirre y Manuel Astorga.
Pedro Araya, Rubén Marcos, Carlos Campos Juan Carlos Oleniak y Leonel Sánchez.
Director técnico: Luis Alamos Luque.
Tardará tan sólo dos años en el profesionalismo para lograr su primer título en el año 1940. Pero si lugar a dudas durante los años 60 es cuando es el club logra sus mejores éxitos con seis títulos el los años: 1959, 1962, 1964, 1965, 1967, 1969. Y varios jugadores de ese plantel participarán activamente en el mayor éxito deportivo del balompié nacional, como es el tercer puesto en el mundial organizado en nuestro país en 1962.
Deberán pasar 25 años y una estadía de una año en la segunda división (1989) para que los hinchas de la “U” puedan gritar nuevamente Campeón en el año 1994. Logró que repetirá al año siguiente (1995). Torneos que también logra seguidamente en los años 1999 y 2000, convirtiéndose así, el último campeón del siglo y el primero del siglo XXI. El último campeonato logrado por la “U” es el año 2004 ( Apertura) con la modalidad de torneos cortos.